台東真是一個風景優美並有著豐富的歷史資源和珍貴遺址所聚集的地方，如果缺乏博物館的完善收藏和展示功能，以及專業人員做最有效率的管理和整理時，這些珍貴的文化歷史遺跡就會悄悄消失，這無疑是當地人的損失，更是所有台灣人的損失。
所以在政府重視並且在所有專業人士的努力下，國立台灣史前文化博物館就此誕生，這裡所要展示的理念是以寬廣的眼光，結合人類、自然與文化三者之間關係，讓大家了解之後，進而融入愛護自然和文化的觀念。